二手氣質聯用儀被廣泛應用于復雜組分的分離與鑒定，其具有GC的高分辨率和質譜的高靈敏度，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具。它是在離子源部分將樣品分子電離，形成離子和碎片離子，再通過質量分析器按照質荷比的不同進行分離，最后在檢測器部分產生信號，并放大、記錄得到質譜圖。
一、開機操作
打開載氣（He氣），設置分壓閥壓力至0.5MPa。
2、打開計算機，進入WindowsXP系統。
3、打開氣相色譜7890NGC、質譜5975NMSD電源，等待儀器自檢完畢。
4、在計算機桌面雙擊工作站圖標“Instrument#1”，進入MSD化學工作站。
5、儀器穩定1～2小時。
6、觀察真空泵狀態；觀察離子源、四極桿溫度的實際值是否達到設定值。
7、設定條件，測定樣品。
二、關機操作
1、在儀器控制菜單中，單擊“視圖”菜單，選擇“真空控制”，進入診斷與真空控制界面。
2、在真空菜單中選擇“放空”，工作站將柱溫設為30℃，關閉輔助加熱。該過程大約需要40分鐘。
3、等待放空結束，退出工作站，關閉計算機。
4、分別關閉氣相、質譜電源。
5、關閉載氣He。
氣質聯用儀是一個氣體運行的系統，因而儀器的密封性相當重要。毛細管柱進入質譜腔中的長度不適當，太長或太短都不行。墊圈要松緊合適，太松會有漏氣的隱患，太緊則會壓碎墊圈，每次更換色譜柱時需要更換新的密封墊圈。清洗離子源時打開腔體后要注意其密封性。
